Stasiun Pasar Senen
- KA Singasari Relasi Pasarsenen-Blitar
- KA Gaya Baru Malam Selatan Relasi Pasarsenen-Surabaya Gubeng
- KA Jayabaya Relasi Pasarsenen-Surabaya Turi
- KA Brantas Relasi Pasarsenen-Blitar
- KA Bangunkarta Relasi Pasarsenen-Jombang
- KA Gumarang Relasi Pasarsenen-Surabaya Turi
- KA Dharmawangsa Ekspres Relasi Pasarsenen-Surabaya Turi
- KA Fajar Utama Solo Relasi Pasarsenen-Solo Balapan
- KA Mataram Relasi Pasarsenen-Solo Balapan
- KA Fajar Utama YK Relasi Pasarsenen-Yogyakarta
- KA Sawunggalih Relasi Pasarsenen-Kutoarjo
- KA Jayakarta Relasi Pasarsenen-Surabaya Gubeng
- KA Kertajaya Relasi Pasarsenen-Surabaya Turi
- KA Matarmaja Relasi Pasarsenen-Malang
- KA Progo Relasi Pasarsenen-Lempuyangan
- KA Bengawan Relasi Pasarsenen-Purwosari
- KA Serayu Relasi Pasarsenen-Purwokerto
- KA Airlangga Relasi Pasarsenen-Surabaya Turi
- KA Bogowonto Relasi Pasarsenen-Lempuyangan
- KA Gajahwong Relasi Pasarsenen-Lempuyangan
Stasiun Jakarta Kota
- KA Kutojaya Utara Relasi Jakarta Kota-Pasarsenen-Kutoarjo
